git init

O Git gerencia os repositórios no mesmo diretório/pasta da aplicação. Para inicializar o repositório, vá até o diretório do projeto e execute git init.

cd meu/projeto
git init

Você verá que o diretório conterá uma pasta oculta chamada .git. Jamais edite o conteúdo dessa pasta diretamente. O Git gerencia ela por você.